Agustín Delgado fue el goleador de la Selección en el camino al Mundial del 2006. Marcó un tanto clave en el duelo ante Bolivia.El 3 de septiembre del 2005, Bolivia recibió a Ecuador en el Hernando Siles de la Paz. En ese partido, el héroe ecuatoriano de la jornada fue Agustín el ‘Tin’ Delgado, al marcar los dos tantos de la victoria de Ecuador sobre Bolivia. Aquí, se muestra cómo fue su segundo tanto: el ariete recibió un centro de Édison Méndez y el ‘Tin’ marcó con un fuerte remate de cabeza.

Para el 2006, la figura de Ecuador fue Édison Méndez. Goles de larga y corta distancia, generador de juego en el medio campo y clave para sus anotaciones. Se encargó de ponerse el hombro al equipo y con sus centros ayudar a que Ecuador anote sus goles.

Para la siguiente eliminatoria, la posta la tomó Iván Hurtado. El defensa central que también jugó en Europa se convirtió en el líder de la Selección. Su experiencia, luego de jugar en 13 equipos de Asia, Europa y América, lo hacía idóneo para tener el brazalete de capitán. Además, con Ecuador ya había disputado siete Copas América y era uno de los jugadores con más de 100 partidos internacionales.

En la eliminatoria al 2005, los guardianes del arco de Ecuador fueron Edwin Villafuerte y Christian Mora. Sin embargo, el ‘Conde’ Mora se convirtió en la figura del arco tricolor. Estuvo presente en la eliminatoria en el 2005 y en los partidos del 2006.

Con dos goles de Agustín Delgado, el primero al minuto 8 de la etapa inicial y el segundo al 49´del complemento, Ecuador venció en condición de visitante a Bolivia. Si bien el rival no era directo, en la lucha por un puesto en el mundial, para el equipo dirigido por Luis Fernando Suárez, los tres puntos conseguidos en La Paz permitieron que Ecuador asegure un cupo directo para el torneo que se disputaría en Alemania.

Como en la eliminatoria para el mundial de 2002, Uruguay se convirtió en el rival directo de la Selección de Ecuador para conseguir la clasificación. El empate cero a cero, que obtuvo el equipo nacional, el 8 de octubre de 2005, en el Olímpico Atahualpa, permitió que el plantel comandado por Luis Fernando Suárez sea el que califique de forma directa al mundial. Su rival, por segunda eliminatoria consecutiva, tuvo que buscar su paso al mundial por el repechaje.

Bajo el mando técnico de Luis Fernando Suárez, Luis Antonio Valencia fue la figura juvenil en el equipo tricolor que empezó a proyectarse por la banda derecha.

El combinado tricolor tuvo una destacada actuación al avanzar a los octavos de final por detrás de Alemania tras derrotar a Polonia y Costa Rica.

Para el 2003, surgió un nuevo diseño con el cual se jugaron las eliminatorias hasta que para el Mundial de Alemania 2006, se introdujo una camiseta que fue la única de marca nativa.